إن جامعة المعارف ملتزمة باتباع التطبيقات والمبادئ الإدارية السليمة، فنهجنا في الإدارة السليمة كلّي وشامل وذلك من أجل أداء واجباتنا على أكمل وجه فنكون مستعدين للمساءلة أمام المساهمين وأمام المجتمع ككل، كما ونعمل بطريقة مسؤولة اجتماعيًا في كل مجالات نشاطاتنا الأكاديمية والبحثية.

ومن وحي رؤية ورسالة الجامعة، ومستفيدين من "بطاقة قياس حوكمة الجامعات" (النسخة الثانية 2015)، وهي مبادرة من وزارة التربية والتعليم العالي والبنك الدولي، فإن نموذج الحوكمة (الإدارة) الخاص بجامعة المعارف يتضمن الأبعاد التالية:

1. التخطيط الاستراتيجي
2. القرارات الإدارية القائمة على الأدلة
3. الاستقلالية الأكاديمية والإدارية
4. المساءلة
5. المشاركة

ويكمن في صميم الإدارة السليمة لجامعة المعارف الالتزام الثابت بضمان الجودة التعليمية والنزاهة الأكاديمية. إن قوانين جامعة المعارف تؤيد إطار عمل إداري لضمان الجودة الشاملة ضمن مبادئ وأهداف محددة بوضوح  ومستندةً على معايير ومبادئ توجيهية وأساليب محلية وعالمية لضمان الجودة.

إن أهم ركائز إطار العمل تتضمن: الوضوح والثبات في الرسالة والرؤية والأهداف التعليمية، والالتزام بالتحسين المستمر، واستخدام الإجراءات المتينة وأساليب التقييم، والقيادة الحكيمة ذات الأخلاق العالية، والمساهمة في المسؤولية الاجتماعية والسلوك الأخلاقي، وتشجيع منهج التعلم المتمركز حول الطالب، وتحفيز التميز والإبداع.

إن الإدارة السليمة تمثل طليعة أولويات الخطط الاستراتيجية لمجلس الأمناء والإدارة العليا لجامعة المعارف. ونحن كمؤسسة تعليم عالي نعمل ضمن سياق مختلف محليًا وإقليميًا ودوليًا ونسعى إلى الانتساب إلى مؤسسات التربية والتعليم العالي وفقًا لأطر العمل ومعايير ضمان الجودة المذكورة أعلاه.